История музея берет начало с 70-х годов прошлого века, когда любители истории объединились в Клуб знатоков. В 1991 года решением исполкома Йошкар-Олинского городского Совета народный депутатов был создан Музей истории города Йошкар-Олы.
Однако притворить в жизнь удалось не сразу. Лишь в 1996 году на основании постановления главы столичной администрации учреждению было предоставлено здание на ул. К. Маркса, где-то когда-то проживал царевокошайский купец-лесопромышленник Трофим Чулкова, пишет «Марийская правда».
Ранее МедиаПоток писал, что Глава Марий Эл поздравил старейший музей республики с юбилеем. Руководитель региона отметил, что музей имеет свою богатую историю и является одним из главных культурных учреждений на территории Марий Эл.
